Существует постановление № 755 от 31.08.2013. Рособрнадзор упоминает п. 12., как один из наиболее нарушаемый:

пункта 12 - при проведении приема на обучение организацией:
- нарушены сроки внесения сведений о лицах, подавших заявления о приеме на обучение в образовательную организацию;
- не внесены сведения: о правилах приема, о количестве мест для приема на обучение с указанием формы обучения, в т.ч. квоты целевого приема, о количестве мест для приема по договорам об образовании за счет средств физических и (или) юридических лиц; об особых правах, предоставленных поступающим при приеме в организацию; результаты вступительных испытаний; списки лиц, рекомендованных к зачислению, а также заявления лиц, отказавшихся от зачисления.

В итоге - привлечение к административной ответственности.

Какие действия может принять Рособрнадзор? Вызвать например, ответственного секретаря для выяснения обстоятельств, как крайняя мера - приостановить деятельность вуза (например, в случае жалобы абитуриента на результаты приема, а приказа в ФИС ГИА не окажется).

Проверку наличия приказов в ФИС контролирующие органы могут проводить в любой момент, конкретного регламента или даты нет.

Если не выгружен вовремя - нужно выгрузить как можно скорее. В том числе чтобы другие могли проверить абитуриентов зачисленных в два вуза разом. Принципиально сначала звонят и предупреждают что надо поправить.